Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cpne9Q1RLL3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cpne9Q1RLL3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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