Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc162pQ0VG85 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms