Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vps8Q0P5W1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms