Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spata18Q0P557 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms