Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf541Q0GGX2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms