Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
MestQ07646 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms