Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Siah1bQ06985 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Siah1bQ06985 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms