Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Apoc2Q05020 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms