Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Thbs2Q03350 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms