Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NfiaQ02780 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NfiaQ02780 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NfiaQ02780 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NfiaQ02780 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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NfiaQ02780 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NfiaQ02780 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NfiaQ02780 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NfiaQ02780 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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