Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Htr1fQ02284 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms