Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snai1Q02085 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms