Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cacna1cQ01815 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms