Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nme2Q01768 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nme2Q01768 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms