Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec23aQ01405 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec23aQ01405 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms