Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rbp4Q00724 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms