Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smarcc1P97496 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms