Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps3aP97351 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms