Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tp53bp1P70399 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tp53bp1P70399 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tp53bp1P70399 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tp53bp1P70399 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tp53bp1P70399 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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