Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Usp9xP70398 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms