Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SbdsP70122 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms