Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vamp3P63024 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vamp3P63024 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms