Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vps33bP59016 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms