Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms