Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ercc3P49135 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms