Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TgfaP48030 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TgfaP48030 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TgfaP48030 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms