Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syt1P46096 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms