Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx1-2P42580 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx1-2P42580 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms