Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Rpl28P41105 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Rpl28P41105 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Rpl28P41105 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
Rpl28P41105 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Rpl28P41105 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Rpl28P41105 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Rpl28P41105 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Rpl28P41105 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Rpl28P41105 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Rpl28P41105 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms