Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Lig1P37913 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lig1P37913 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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