Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms