Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RxrgP28705 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms