Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RxrbP28704 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RxrbP28704 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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