Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NapbP28663 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NapbP28663 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NapbP28663 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NapbP28663 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NapbP28663 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NapbP28663 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms