Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Dusp1P28563 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Dusp1P28563 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms