Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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