Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Xrcc6P23475 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc6P23475 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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