Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxd8P23463 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms