Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18526 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18526 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18526 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms