Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sptan1P16546 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sptan1P16546 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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