Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nr4a1P12813 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nr4a1P12813 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms