Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Defa1P11477 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms