Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Calm2P0DP27 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Calm2P0DP27 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms