Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnmt3cP0DOY1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms