Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxb3P09026 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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