Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P01853 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01853 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
P01853 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
P01853 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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