Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ifnb1P01575 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms