Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mtatp6P00848 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms