Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ComtO88587 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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ComtO88587 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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ComtO88587 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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ComtO88587 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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ComtO88587 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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ComtO88587 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ComtO88587 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ComtO88587 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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