Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Col5a1O88207 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Col5a1O88207 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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